基因表达和细胞命运决定需要精确和协调的表观遗传调控，复杂的染色质三维（3D）重塑在生命过程中发挥着关键作用。染色质3D重塑的多层次结构，包括染色质环（chromatin loops）、拓扑相关结构域（TADs）、染色质区室（chromatin compartments）和相分离（phase separation），共同调节染色质状态和转录活性。近年来借助3D基因组信息学，基于不同策略的生物化学和成像方法已经进展到能从单细胞水平揭示生物大分子之间的相互作用。

2022年12月9日，同济大学生命学院张赫教授团队应Computational and Structural Biotechnology Journal杂志主编Gianni Panagiotou教授邀请，发表题为Novel biological insights revealed from the investigation of multiscale genome architecture的综述长文，系统总结了近年来染色质三维重塑的形成、作用机制和功能意义，并全面概述了用于分析多尺度基因组学的最新实验和计算方法，为研究染色质3D重塑提供了新见解。

同济大学博士研究生丁天宜为该文章的第一作者，同济大学张赫教授为该文章的通讯作者。该工作获得了国家重点研发计划、国家自然科学基金委和上海市科委等项目的重要支持。